يمكن استخدام الحقن المجهري عند وجود سبب يمنع حدوث الإخصاب أو يجعله صعبً ويعتبر الحقن المجهري الحل المثالي في هذه الحالات:

● التصاقات قناة فالوب الشديدة

● حالات بطانة الرحم المهاجرة

● حالات ضعف السائل المنوي الشديدة

● حالات تاخر الحمل غير معروفة السبب

و يتم الاستعانة باحدث أساليب الحقن المجهري العالمية:

● التحليل الوراثي للأجنة( PGD)

● الميكروسكوب فائق التكبير للحيوان المنوي (IMSI)

● منظار الاجنة (Embryo-scope)